Apple tiene sus trucos, y no necesariamente tienen que decirte que estás arrestado o no, simplemente te cancela algunos servicios, en este caso es iBooks, se actualizó a la versión 1.2.1 a inicios de esta semana, pero la actualización que "corregía unos errores" tiene sus sorpresas.

Lo que hace es que envia códigos binarios a su "Store" para ver si tu dispositivo está Jailbrakeado, si sale positivo será un dispositivo con "Jailbreak", y no permitirá el acceso de iBooks para leer un libro o PDF y te pondrá el siguiente mensaje, diciendo que tienes un error con la configuración. ¿Coincidencia?
Español: Hay un problema con la configuración de tu iPhone. Por favor, restaura con iTunes y vuelve a instalar iBooks
Lo único que tienes que hacer es quitar el Jailbreak para eliminar este problema, pero no se alteren que hay una solución y no tienes que quitar el jailbreak, por el momento NO ACTUALIZAR IBOOKS.